扁桃体是重要的免疫器官。在受到外界炎症刺激后，参与细胞免疫和体液免疫。扁桃体产生的免疫球蛋白免疫力强，能抑制细菌对呼吸道黏膜的粘附、生长和扩散，对病毒起抑制扩散和中和作用，能对付侵入机体的各种致病微生物，起到抗病作用。
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